赤霞珠是世界上最受歡迎的釀酒葡萄品種,科學家們利用復雜的軟件對其進行了基因測序。基因測序技術可以讓我們更好的了解釀酒葡萄是如何進化以及如何適應氣候變化的。由于葡萄酒產區受到氣候變化的影響,該研究結果有利于找到培育頂級葡萄品種的方法。
參與赤霞珠基因組計劃的著名科學家、加州大學戴維斯分校葡萄遺傳學專家Dario Cant副教授說:“研究中所指的技術進步,是指揭示了赤霞珠和其他釀酒葡萄品種之間的不同,這項研究可以幫助葡萄育種者把優良的特性融入到新品種中。”
該軟件稱為FALCON-unzip,是太平洋生物科學公司(Pacific Biosciences)結合新的DNA測序技術開發的。研究人員用這種方法獲得了三種生物體的基因組,其中包括赤霞珠,軟件的詳細介紹及測序結果發表在10月份的《Nature Methods》雜志上。
雖然早在2007年,意大利和法國研究人員首次公布了葡萄的基因組測序,但當時使用的是專門為測序培育的品種,不是釀酒葡萄品種,而此次研究使用的是商業上可用的赤霞珠品種。
Cantu解釋說:“目前最受歡迎的葡萄品種是雜交品種,對它們進行詳細分析很復雜,也很困難。我們現在知道,赤霞珠是品麗珠和長相思的雜交后代,這可以幫助我們解釋它固有的復雜性,以及為什么很難確定赤霞珠品種特定的遺傳特征。”
Cantu認為,該技術最大的應用潛力是幫助種植者應對氣候變化對葡萄的影響。他說:“現有的葡萄栽培區可能很快變得不太適合葡萄生長,如果人們希望繼續種出好葡萄來釀造高品質葡萄酒,這些品種應該可以更加適應高溫、干旱,甚至鹽度。”
編制各種葡萄品種基因組目錄有助于準確描述遺傳標記與釀酒師想要的特定風味、葡萄酒中健康的化合物、抵抗葡萄園病蟲害以及其他性狀之間的關系。這些數據可以幫助人們通過育種或者遺傳修飾的方法進行不同品種之間的基因組合。你想得到一種既具有薩格蘭蒂諾(Sagrantino)風味特點又具有白布娃(Blanc du Bois)品種耐濕性的葡萄嗎?科學家可以識別出特定的遺傳標記,并進行相應的培育。
測序技術還可以幫助科學家更好的了解葡萄品種的歷史。最近的一項研究發現,黑皮諾之所以經常出現突變,可能是由于它能夠吸收攻擊病毒的遺傳物質。這些信息可以幫助人們在基因水平上了解葡萄發生了哪些變化。
通過研究給定品種的基因組,科學家可以發現它們的父母所遺傳的各種性狀。例如在赤霞珠基因組中,哪些遺傳物質來自品麗珠,哪些遺傳物質來自長相思呢?更重要的是,他們是如何一起配合工作的?
Cantu認為,這僅僅是一個開始。在未來幾年,我們將獲得更多知識,例如最優質的釀酒葡萄品種是如何工作的?如何讓它們變的更好?